Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms