Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLVAPQ9BX97 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms