Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BRIP1Q9BX63 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms