Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GATA5Q9BWX5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms