Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMUB1Q9BVT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMUB1Q9BVT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms