Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UPK3BQ9BT76 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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UPK3BQ9BT76 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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