Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TINF2Q9BSI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TINF2Q9BSI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms