Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM29Q9BSF4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms