Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MXRA8Q9BRK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MXRA8Q9BRK3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms