Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTP3Q9BQQ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms