Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GAL3ST1Q99999 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GAL3ST1Q99999 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms