Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CITED2Q99967 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms