Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUSP9Q99956 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms