Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRX2Q99811 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX2Q99811 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms