Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CGREF1Q99674 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGREF1Q99674 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms