Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EYA3Q99504 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EYA3Q99504 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms