Protein–RNA interactions for Protein: Q99426

TBCB, Tubulin-folding cofactor B, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCBQ99426 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBCBQ99426 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBCBQ99426 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms