Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNKPQ96T60 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms