Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC1Q96RQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCCC1Q96RQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms