Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN4Q96NY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN4Q96NY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms