Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD11Q96NU1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD11Q96NU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms