Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms