Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF599Q96NL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF599Q96NL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms