Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1Q96NA8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSNARE1Q96NA8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSNARE1Q96NA8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms