Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74BQ96LY2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms