Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP8Q96LD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms