Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM47Q96LD4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms