Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms