Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAMP1Q96JM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms