Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPIP1Q96JH7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms