Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAGED4Q96JG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAGED4Q96JG8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms