Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms