Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF496Q96IT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF496Q96IT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF496Q96IT1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms