Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA7LQ96GN5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms