Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms