Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEIL1Q96FI4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEIL1Q96FI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms