Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX11Q96FC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms