Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGF29Q96ES7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms