Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD3Q96ES6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms