Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXPE2Q96DL1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXPE2Q96DL1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms