Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms