Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF34Q969K3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms