Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLP1Q92989 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLP1Q92989 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms