Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO1Q92973 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms