Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRAT1Q92837 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRAT1Q92837 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRAT1Q92837 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms