Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHX38Q92620 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX38Q92620 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms