Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BAP1Q92560 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms