Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCG3Q8WXD2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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