Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJA4Q8WW22 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJA4Q8WW22 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms