Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf3Q8WVX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms